Bir mekatronik sistem tasarımı için öncelikle ihtiyaç ve hedeflerinin belirlenmiş olması gerekmektedir. Bir mekatronik mühendisi, derenin debisini düzenleyen açma – kapama (Penstock) sistemi de tasarlayabilir. Ya da bir fabrikanın içerisinde yer alan üretim tesisinin konveyor bantını da tasarlayabilir. Hatta konveyor bant ile kalmaz sensör teknolojisi ile konver üzerinde montaja giden ürünlerin boyut ya da renklerine göre ayrım yapan üretim süreçlerinin tasarımını da yapabilir. Veyahut bir uçağın iniş takımlarının tasarımı da mekatronik mühendisinin görevi olabilir. Bunların hepsi karmaşık gelmesine karşın hiçbirisi tek başına bir kişinin işi de olmayabilir. Mekatronik mühendisi buradaki otomasyon sistemini tasarlar. Yetkinlikliğine göre buradaki akışın programlamasını yapması gerekebilir. Burada verilen örneklerin her birisi mühendisliğin bir parçasıdır. Mekatronik Mühendisliği, makine mühendisliği gibi ana bir disiplin olmadığı için hiçbir zaman tek bir noktada sorumluluk sahibi olmaz. Bu nedenle disiplinlerin entegrasyonu açısından daima ihtiyaç duyulan konumda bulunur.